本故事以被武力和恐怖支配的本能字学院为舞台，以为父报仇的转校生少女为中心，围绕着在学园中“执牛耳者”的学生及学生会四大天王间的激战故事展开。缠流子和鬼龙院皋月，两人为本作的主人公。在本作中，皋月用极制服的力量支配着学园，而流子为查明父亲死亡的真相而与皋月对抗。在这由力量支配的学园中，由于手持片太刀铗的转校生的到来，引起了动乱，这一场各个能力者均被打倒的故事因此而开始！

自小一起长大的少女花与爱丽丝是一对亲密好友，但两人性格迥异，爱丽丝活泼好动，见爱就追，花则天性害羞，不敢同喜欢的男生讲话。在每天陪伴爱丽丝尾随其一见钟情的高校男生时，花也偷偷恋上了经常与该男生结伴同行的宫本。花与爱丽丝双双考进宫本所念书的高校，花也设法成为了宫本所在的相声社团的社员。某次意外令宫本患上短暂性的“记忆丧失”，花趁机编出自己是宫本曾开口示爱的对象，两人谈起伪恋爱。眼看谎言越撒越多接近无法收场，花情急之中把爱丽丝拉了进来，不想她自己成了“电灯泡”。

1800年前，人类恶念凝聚而成的怪物——八歧大蛇肆虐人间，被以草薙家族为首的武术家们用三件神器封印。 现代，世界综合格斗大赛 - THE KING OF FIGHTERS（简称KOF）召开，全世界的格斗高手集聚南镇。草薙家族的传人-草薙京来到南镇之后，他敏锐地感觉到了大蛇之力的复苏，一切迹象表明KOF大赛背后隐藏着一个巨大的阴谋。随着KOF大赛的召开，所有的队伍，抱着各自的目的，渐渐被命运之手拉到了一起。而幕后的邪恶势力已然布下了天罗地网，准备将所有的格斗家一网打尽。正义与邪恶的对决一触即发！

卡门、堤比、莲娜和布莉姬是四个十五岁的美国少女，由于她们的妈妈一起参加孕妇韵律舞课程班，因此，她们的缘分，像是打从娘胎起就注定了的。她们是在同一个夏末出生的，孩提时代常在一起玩耍，但从小学起，因为不在同一间学校，大家的生活只跟暑假息息相关。16岁的夏天，四个亲如姐妹的好朋友将第一次面临分离，依依不舍的她们决定最后一次一起逛街。偶然的一个机会，在一家便宜的二手商店里，卡门买到了一条牛仔裤，瘦小的堤比心不在焉地穿上了它，谁知效果好得令人难以置信！接下来，莲娜、布莉姬、卡门依次换上了这条牛仔裤，无论高矮胖瘦，谁

一位游戏大亨的离奇身亡改变了穷苦少年陆水银的命运，在墓地做兼职守墓人的他意外获得了五个亿的遗产，但万万没想到他会阴差阳错将这笔钱全数充入了虚拟游戏币，更没想到这会让他穿越到神秘的“盗墓”游戏里。

某个夜晚，维京小岛突发大火，在领袖斯托里克的指挥下，大火迅速被扑灭。从火中侥幸逃生的高柏坚信这一定是那条传说中四处寻找完美骨架作盔甲的骨碎龙所为，虽然火灾的原因似乎是他那条良在炉子边的脏内裤。他的说辞遭到斯托里克的耻笑，而希卡普则对此坚信不移，他叫上阿斯特丽德、鱼腿、双胞胎等好友，同高柏一同划船出海寻找骨碎龙。漫长无聊的旅途中，高柏为他们讲述从小时候被骨碎龙追杀的经历，随着故事的进行，他的叙述越来越没边儿，让人难以相信。突然之间，小船触礁搁浅，而他们的冒险才刚刚开始……

一晃3年过去，当初穿着同一条牛仔裤分享心事的好姐妹，现在已经各自考上不同的大学。虽然依然保持联系，经常分享或快乐或伤心的经历，但分离千里、长大成人的她们毕竟有了各自不同的生活、朋友和兴趣。不过，大学的第一个学年就要结束，又是一个夏天即将来临，四个好姐妹又将重聚在一起。而这一年的夏天，又会发生怎样感人的趣事？

京岛国的少年小嗝嗝是部落统领伟大的斯托里克的儿子，他非常想像自己的父亲一样亲手屠龙——这些飞龙是岛上维京人放牧羊群的主要天敌——但他每次出现在部落屠龙的战斗中都只给大家徒增烦恼。在一次对抗飞龙的战斗中，希卡普偷偷用射龙器击伤了一只最神秘的“夜之怒龙”，并背着族人放生、豢养，甚至驯服了这只龙，还给它起名“无牙”。希卡普的神秘行径引起了一同训练屠龙技巧的女孩阿斯特丽德的怀疑。阿斯特丽德发现了希卡普的秘密，却同时被身骑“无牙”御风而飞的美妙体验所震撼。格雷决定在屠龙成人礼上向远征归来的斯托里克和族人讲明真相，说

在播磨，武藏一行遇见了上杉龙臣统领的大型武士团——上杉武士团。他们的目的是讨伐盘踞在淡路岛的巨大鬼神“炮战龙八岐大蛇”。在那里，还有武田尚虎率领的武田武士团，与武藏同龄的武士岛津秋弘、尼子胜巳，以及稍显不通世俗的腼腆公主猿渡满等人。在各种想法翻涌的涡旋之中，武藏一行也加入了灭鬼的战斗。而他们要挑战的八岐大蛇，则是号称“从未被人伤及分毫”、铜墙铁壁般的鬼神。武藏和同伴们将要面对的，是一场前所未有的激战。

为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎“海螺引擎“，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。并且派遣未性别化的“巫女”担任驾驶员，于是，她们成为了被称为Simoun小队的战斗小队成员，展开了一场激烈的战斗。