四只生活在纽约下水道里的小乌龟因为有毒的放射性物质的污染，开始向他们接触最多的物种--人类“进化”，并在鼠师傅斯普林特的谆谆教导下，变成了四个最可爱、最善良、最勇敢的绿壳英雄！第一次走出秘密栖身的下水道，这些忍者兄弟就将面对一个奇妙又危机四伏的世界——大都市纽约。敌人比以往更强大，忍者龟们对比萨饼的热爱有增无减，他们的忍术日臻完美，搞笑功力也更有长进！

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绿日乐队在春田镇办了环保演唱会，惨遭冷遇，成员落水而亡。为了悼念，教堂举办了弥撒仪式。辛普森一家又迟到了，而且爷爷突然灵魂附体，说出了灾难降临的预言。巴特因为踩着滑板裸奔被罚，得到了邻居弗兰德斯的帮助，情同父子。丽莎遇到了志同道合的爱尔兰男孩柯林，两人暗生情愫。荷马丢弃核废料与垃圾严重污染了水资源。他买回了一头猪，引起了妻子玛姬的不满，小女儿美姬倒是乐得其中。一个长着无数眼睛的怪异生物让大家意识到了问题的严峻性。居民大会上，丽萨提出的环保议案被否决，问题传到了施瓦辛格总统的耳朵里。政府下令将污染严重的春田

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