美军阿拉巴马号核子潜水艇再次出航任务时却意外进入时光隧道，只有狄更斯舰长一人生还，虽然X与大众怀疑他的说词，但是蓝斯博士却肯定这可能性，并请他担任时光之旅的潜水艇指挥官，与漂亮能干的马杰丽女博士，重闯神秘百慕达三角洲。他们终于在同一地点再次进入2077年的未来世界，遇到正阴谋引发世界核子大战以达到控制全世界野心的恶魔布莱德克。幸好狄更斯在2077年的后代约翰是抗暴领袖，在一番暴力抗争后终于协助他们逃回潜艇！为了挽救未来世界，他们必须安全返抵美国，改变罪恶的人类历史命运。

在未来时空里，社会动荡，权利集中在“首领”的独裁政府手中，所有人的生活都被密切监视，人们没有自由、没有隐私。首领”秘密培养杀手铲除异己，掌控杀手头脑是首领的左膀右臂，代号“控制者”。而“秃鹫”是这些杀手中的佼佼者。秃鹫在一次执行任务的时候遇到了一个酷似他亡妻的女子妮娜，一时手软的秃鹫放过了妮娜。但违背命令的秃鹫被首领放弃了，但控制者提出通过给秃鹫植入“记忆”，把他改造成完美武器。术后的秃鹫逃离了组织，并救下妮娜一起逃亡。

在不远的将来，人类经历了一场变革式的战争和灾难，之后的幸存者们由独裁政府和被称为元首的独裁者控制。人们无时无刻不生活在监视和控制之中。秃鹰是国家的杀手，负责刺杀对政府不利的敌人。在一次刺杀行动中，被刺杀者的一番话，让他开始思考自己的敌人到底是谁。