洪武二十五年，三名孩童从诏狱中逃出，锦衣卫宋鹤鸣因替他们断后而死，小陆铮误以为生父被李雾所杀，李雾划伤宋真逃走。十年后，陆铮成了锦衣总旗。他的搭档谢铿然将夜不收千总李东方暗藏，而李雾也为盗帖混入府中。

九如法王和肥源一郎等人经过暴力和血腥的抢掠攻占了台州，九如法王和肥源一郎对此战的收获很是满意。为了收复台州，戚继光派杨天纵等人兵分两路，一路去台州找到卧底“小武侯”和刺杀倭寇头领，一路去大门岛直捣倭寇老巢。然而两路人马进行的并不顺利......

倭寇侵犯明朝国界，张朱两位将军亲自带兵与倭寇作战，将倭寇击退，却遭到奸臣严嵩的陷害入狱。神雕大侠杨过之后杨天纵被疯五偷钱，两人大打之后结为兄弟。郭向梅接到师门命令，前往营救张朱两位将军。

宛如格格逃婚来到清河县，却因无银两而陷入困境，无奈中以借为名偷入一户人家，却看到了大清库银，于是隐藏身份向县令伍四六举报，举报之人是战功显赫连皇上都要敬三分的退休将军。宛如咬住常胜不放，伍四六暗中调查…

相辅布阿布受国王之托来大清国寻找大公主，伍四六奉旨协助调查，二公主却从中作梗，最终布阿布通过一串项链，认出大公主就是麻翠姑，麻翠姑大呼误会，说出了项链的主人，真公主找到了，她却不愿意离开清河县的故事。

清河县来了两个神汉，借助天降陨石和各种法术招摇撞骗，伍四六在揭发他们的过程中，又碰上了神汉预言的日食天遣。导致越来越多的民众卷入了邪教的大潮，甚至连麻翠姑都投到对方名下。

清河县最近常常有壮年男子失踪，引来一阵恐慌，国舅爷来清河县督办此案，却也遭到了被绑架的结局。伍四六只身前往黑煤窑调查案情，却遭遇了与黑矿主女儿牛香香的爱情。在牛香香的帮助下，伍四六成功救出国舅爷

主要讲述了伍四六原来有一个救过他命的双胞胎哥哥伍四五，这让伍四六非常开心，并帮助伍四五在清河县开了一家生产农肥的工厂。京城出现地沟油，皇上派人来秘查，伍四五迷倒伍四六冒名顶替，成功的骗过皇上派来的钦差的故事。

　伍四六治县有方，皇上表彰了伍四六，并表示额外再表彰一人，人选由伍四六推荐，夫人麻翠姑有否决权。此令一出，主簿与四个班头皆不淡定，五官为这个荣誉展开明争暗斗。适时县里发生一宗命案，而案件关系到多年前……

影片主要讲述了伍四六进京面圣，揭发考试弊案，不料招惹了九门提督阿克占，被他威逼利诱，麻翠姑在寿宴上收到了孤儿院捐款，对阿克占好感徒升。伍四六通过重新笔试，鉴别出作弊者，顺藤摸瓜，很快就要查到阿克占头上……