邪恶的可汗逃脱十五年前被寇克船长拘禁的星球，他本人是一位智勇双全的领袖，但此刻已变成一个邪恶的狂人，他誓言要向寇克船长讨回血仇。于是他先劫持了一艘联邦战舰，后又偷取了寇克船长的儿子和旧情人制造的毁灭性武器。并引诱企业号投入他精心设计的圈套……

1940年代，法西斯德国统治下的罗马尼亚，游击队和反法西斯抵抗组织不断袭击敌人的码头、车站和桥梁。前线吃紧，统治者却找不到向前方运送军火的船长。此时，抵抗组织却因缺乏武器而苦恼，地下党员托玛（Lazar Vrabie饰）为了从敌人手中搞到大批军火，混入码头囚犯队伍，以期登上运军火的轮船。新婚的船长米哈依（弗拉比耶 饰）是一个疾恶如仇的爱国者，他的妻子安娜（爱琳娜·帕翠斯库饰）美丽善良。托玛被米哈依选中做水手，运送军火去前线。在船上，他们合伙干掉了押送军火的德国兵，排除漂流在多瑙河上恐怖的水雷，把武器运送给

疯狂博士苏伦野心勃勃，藉着超卓武器毁灭宇宙，并走到一处没有时空界限的领域，进行连串恐怖计划。为了挽救人类安危，23世纪的太空船冒险号的队长寇克决定穿梭时空，与24世纪的冒险号船长比加会合，阻止外星侵略行动。

迷人的杰克船长（约翰尼·德普 饰）又回来了，这次，他遇到了更为强大的敌人——传说中的不死人大卫·琼斯（比尔·奈伊 饰），他驾驶着让人恐惧的“飞行荷兰人”号快船，在速度与装备上，没有任何船能够超越它。杰克船长欠下大卫·琼斯一个血债，他必须赶在最后时限到来之前，找到破解的方法，否则他会永远背负血债，并且在余生永远成为大卫·琼斯的奴隶。当然，杰克船长的好朋友威尔（奥兰多·布鲁姆 饰）也被卷入了他的坏运气当中。因为杰克，威尔和伊丽莎白（凯拉·奈特莉 饰）的婚礼被迫取消，伊丽莎白还被皇家海军关进了监狱，威尔为了救她